A estrutura da comunidade de nematoides oferece eficiente instrumento para o acompanhamento da qualidade e do funcionamento do solo. Entretanto, levando em consideração a grande diversidade de espécies de nematoides estimada, no Brasil as pesquisas nesta área ainda são escassas, principalmente em relação a sistemas agroflorestais. O presente trabalho tem como objetivo avaliar a diversidade da nematofauna em uma área de cultivo de hortaliças em sistema agroflorestal, antes e depois da implantação de plantas de cobertura associadas ao Trichoderma ssp. O trabalho foi realizado em uma propriedade de cultivo de hortaliças no município de Barreiras, Bahia. Previamente foi realizada a coleta de solo da rizosfera e análise da nematofauna presente nesse solo. Posteriormente, plantas de cobertura, nabo forrageiro (Raphanus sativus), crotalária (Crotalaria juncea) e milheto (Pennisetum glaucum) foram semeadas em canteiros subdividos em seis parcelas. Cada canteiro continha as plantas de cobertura com e sem a associação ao produto à base de Trichoderma (Trichoplus JCO®) e um tratamento apenas com produto e sem plantas de cobertura. O delineamento experimental utilizado foi de blocos casualizados, com seis repetições e sete tratamentos, totalizando 42 parcelas. As plantas foram conduzidas no campo por um período de 6 meses sendo posteriormente avaliadas a abundância total, riqueza de gêneros e grupos tróficos. O manejo do solo e as práticas culturais realizadas na área do experimento influenciou no aumento da abundância e riqueza de gêneros de nematoides. Os tratamentos com Trichoderma e nabo forrageiro contribuíram para o aumento de todos os grupos tróficos de nematoides, exceto dos micófagos. A associação das culturas de cobertura crotalária e milheto utilizadas isoladamente ou em associação ao Trichoderma auxiliaram na redução das populações de fitonematoides.